對于食品、藥品而言，罪魁禍首當屬微生物、細菌等污染物，而食品廠凈化工程設計通過以下三個途徑可有效解決根源，達到食品凈化的目的。

1.食品廠凈化車間中，維持良好的通風效果，食品廠凈化車間標準的設計時可一直保持正壓狀態，這樣一來可防止外界非潔凈空氣的進入。還要對氣流進行正確控制，可有效降低車間內空氣污染。

2.為了滿足產品的生產需要，就要保持車間內潔凈度，這就關系到換氣次數。食品廠凈化車間的換氣次數應保證每小時大于15次。

3.通過初、中、高效過濾器對空氣進行過濾，可以有效排除懸浮在空氣中的塵埃、細菌等有害物質。